手術對解除疼痛，促進生育功能效果較好，所以仍為治療子宮內(nèi)膜異位癥的主要措施。保守性的手術主要為切除病灶，分離粘連，重建卵巢，修復組織。
        (1)保留生育功能手術：適用于年輕有生育要求的婦女，特別是采用藥物治療無效者。手術范圍為盡量切除或灼除內(nèi)膜異位灶，但保留子宮及雙側、一側或至少部分卵巢。手術可經(jīng)腹腔鏡或剖腹直視下進行。①腹腔鏡手術：在腹腔鏡下即可確診內(nèi)膜異位癥，也可進行多種手術，包括病灶切除、粘連分離、卵巢巧克力囊腫穿刺抽液后注入無水酒精、卵巢囊腫剔除和卵巢成形術以及卵巢切除術等。一般術后妊娠率可達70%以上，但仍有復發(fā)可能。②剖腹手術：適用于粘連廣泛，病灶巨大，特別是巨大的卵巢巧克力囊腫患者。
        (2)保留卵巢功能手術。將盆腔內(nèi)病灶及子宮予以切除，但要保持一側卵巢或部分卵巢以維持患者卵巢功能。此手術適用于45歲以下，且無生育要求的重癥患者。應警惕少數(shù)患者在術后復發(fā)。
        (3)根治性手術：即將子宮、雙側附件及盆腔內(nèi)所有內(nèi)膜病灶予以切除，適用于45歲以上近絕經(jīng)期的重癥患者。